RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SCNN1DP51172 638 aa9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GDF10P55107 478 aa9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.86□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MEN1O00255 615 aa9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATG7O95352 703 aa9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DPYDQ12882 1025 aa9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SFI1A8K8P3 1242 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LCE2BO14633 110 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DKK1O94907 266 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IL2RAP01589 272 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SCARF1Q14162 830 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SIX5Q8N196 739 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CNKSR1Q969H4 720 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPINT1O43278 529 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 INHAP05111 366 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CLN3Q13286 438 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZFP42Q96MM3 310 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARXQ96QS3 562 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF358Q9NW07 568 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.83□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 STK32AQ8WU08 396 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 XAGE2Q96GT9 111 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NLRP3Q96P20 1036 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SEC13P55735 322 aa9.81□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.8□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LGR5O75473 907 aa9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CENPCQ03188 943 aa9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.79□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BACH1O14867 736 aa9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TNS4Q8IZW8 715 aa9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CARNS1A5YM72 827 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TTLL8A6PVC2 850 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMTNP53814 917 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TLR1Q15399 786 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RETREG2Q8NC44 543 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HINFPQ9BQA5 517 aa9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A6NJY4 79 aa9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 M0R2N6 131 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPC1P35052 558 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RNF217Q8TC41 542 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.74□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SOBPA7XYQ1 873 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EPHA4P54764 986 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MTFR1Q15390 333 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TBCELQ5QJ74 424 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SENP2Q9HC62 589 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP3Q9Y6I4 520 aa9.73□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POTECB2RU33 542 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAN1A2O60476 641 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ERCC6Q03468 1493 aa9.72□□□□□ -0.85
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.71□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM47Q96LD4 638 aa9.71□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDK2AP1O14519 115 aa9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FOXK2Q01167 660 aa9.7□□□□□ -0.86
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POU4F2Q12837 409 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms