RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPYL6Q8N831 410 aa9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPRUQ92729 1446 aa9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 CRB1P82279 1406 aa9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 SBNO1A3KN83 1393 aa9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 AK9Q5TCS8 1911 aa9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHG5O94827 1062 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 HMOX1P09601 288 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXB7P09629 217 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 TMX3Q96JJ7 454 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 USP25Q9UHP3 1055 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 FLT4P35916 1363 aa9.34□□□□□ -0.91
CAPNS1-202ENST00000586851 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 USP6P35125 1406 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 CAVIN2O95810 425 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 MX1P20591 662 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 NEK4P51957 841 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 RBSNQ9H1K0 784 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.33□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 RAPGEF3O95398 923 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2HP62256 183 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP8B2P98198 1209 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 GPT2Q8TD30 523 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP3K5Q99683 1374 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 HIP1O00291 1037 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 PDCP20941 246 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 CHMLP26374 656 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 HSPA4P34932 840 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 NME9Q86XW9 330 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 DIP2BQ9P265 1576 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC4A2P04920 1241 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 TICAM2Q86XR7 235 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 CNTROBQ8N137 903 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 GPATCH3Q96I76 525 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 MEIS3Q99687 375 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 RAD50Q92878 1312 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 SYCE3A1L190 88 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 UQCRHP07919 91 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.29□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 PEAK1Q9H792 1746 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD1Q15327 319 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 SYCP1Q15431 976 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-202ENST00000586851 SSH3Q8TE77 659 aa9.28□□□□□ -0.92
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