RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 HMOX1P09601 288 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 UTRNP46939 3433 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 PALLDQ8WX93 1383 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 AKT1S1Q96B36 256 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.21□□□□□ -0.61
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PTPRM-214ENST00000583153 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRM-214ENST00000583153 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.19□□□□□ -0.62
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PTPRM-214ENST00000583153 SSFA2P28290 1259 aa11.1□□□□□ -0.63
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PTPRM-214ENST00000583153 IL17REQ8NFR9 667 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-214ENST00000583153 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-214ENST00000583153 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-214ENST00000583153 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-214ENST00000583153 YY1P25490 414 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-214ENST00000583153 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.05□□□□□ -0.64
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