RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580633.5

TSPOAP1-AS1-207, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPOAP1-AS1, Length 842 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 C4BP0C0L5 1744 aa28.61■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.61■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 LGR6Q9HBX8 967 aa28.61■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MAP3K5Q99683 1374 aa28.61■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CABP4P57796 275 aa28.6■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.6■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.57■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.57■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.57■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SIK1P57059 783 aa28.57■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.57■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.57■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.56■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.56■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TJP1Q07157 1748 aa28.55■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.55■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.55■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.54■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 IL17REQ8NFR9 667 aa28.53■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ITPK1Q13572 414 aa28.52■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.52■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.51■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.5■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ATP6V1AP38606 617 aa28.47■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.46■■■□□ 2.15
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.44■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SPON1Q9HCB6 807 aa28.44■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ZBTB7AO95365 584 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SLC39A6Q13433 755 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PTGER2P43116 358 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NFE2L2Q16236 605 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MTFR1LQ9H019 292 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TEFQ10587 303 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MCM10Q7L590 875 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NEFMP07197 916 aa28.38■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.38■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.37■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DCTN1Q14203 1278 aa28.37■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 C4AP0C0L4 1744 aa28.37■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GNPATO15228 680 aa28.33■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ANP32CO43423 234 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SMIM5Q71RC9 77 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.32■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.31■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BTBD11A6QL63 1104 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KCNQ3O43525 872 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PHF14O94880 888 aa28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ADRA2BP18089 450 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RIPK4P57078 832 aa28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.25■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MSH5O43196 834 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.24■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MSL1Q68DK7 614 aa28.2■■■□□ 2.1
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