RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 UBXN4Q92575 508 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 SSFA2P28290 1259 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 INCENPQ9NQS7 918 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD62A6NC57 917 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYND15Q9H091 742 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN14Q15678 1187 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 ANO10Q9NW15 660 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC11Q96J66 1382 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 TAF4BQ92750 862 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 METTL24Q5JXM2 366 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 IFT140Q96RY7 1462 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN12O43309 604 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF76P36508 570 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 MYD88Q99836 296 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 USP5P45974 858 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 CASQ1P31415 396 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 RAPGEF3O95398 923 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 PAF1Q8N7H5 531 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 F6X3S4 739 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 ABCF2Q9UG63 623 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 GUCY1B3Q02153 619 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf76Q96K31 380 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 TOPBP1Q92547 1522 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 NESP48681 1621 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 KIF18AQ8NI77 898 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 GBP3Q9H0R5 595 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 SHTN1A0MZ66 631 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 SPA17Q15506 151 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM27P14373 513 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 USP25Q9UHP3 1055 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRM-211ENST00000580170 KIF5CO60282 957 aa24.83■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.83■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 STARD3NLO95772 234 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 URI1O94763 535 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRM-211ENST00000580170 NME9Q86XW9 330 aa24.82■■□□□ 1.56
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