RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 EVA1CP58658 441 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 C8orf37Q96NL8 207 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 SMC5Q8IY18 1101 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 NGLY1Q96IV0 654 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 NRAPQ86VF7 1730 aa23.58■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.58■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 STRN4Q9NRL3 753 aa23.58■■□□□ 1.37
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
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SPNS3-204ENST00000575194 KRT24Q2M2I5 525 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 RGS12O14924 1447 aa23.55■■□□□ 1.36
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SPNS3-204ENST00000575194 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.54■■□□□ 1.36
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SPNS3-204ENST00000575194 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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SPNS3-204ENST00000575194 GCC1Q96CN9 775 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 STK31Q9BXU1 1019 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 IL17REQ8NFR9 667 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS3-204ENST00000575194 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 SLC4A2P04920 1241 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 NUCB1Q02818 461 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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SPNS3-204ENST00000575194 AFF2P51816 1311 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 MYT1Q01538 1121 aa23.48■■□□□ 1.35
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SPNS3-204ENST00000575194 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 VPS72Q15906 364 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS3-204ENST00000575194 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.46■■□□□ 1.35
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SPNS3-204ENST00000575194 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.45■■□□□ 1.34
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SPNS3-204ENST00000575194 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS3-204ENST00000575194 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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SPNS3-204ENST00000575194 ATP10DQ9P241 1426 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS3-204ENST00000575194 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS3-204ENST00000575194 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS3-204ENST00000575194 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS3-204ENST00000575194 ATRNO75882 1429 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS3-204ENST00000575194 FLIIQ13045 1269 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS3-204ENST00000575194 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
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SPNS3-204ENST00000575194 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.39■■□□□ 1.33
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SPNS3-204ENST00000575194 BARGINQ6ZT62 677 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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SPNS3-204ENST00000575194 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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SPNS3-204ENST00000575194 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
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SPNS3-204ENST00000575194 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 SPG7Q9UQ90 795 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 BTBD11A6QL63 1104 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 HMMRO75330 724 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 CEP85Q6P2H3 762 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS3-204ENST00000575194 DCTPP1Q9H773 170 aa23.35■■□□□ 1.33
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