RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 PHKG2P15735 406 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 MTHFSP49914 203 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 AK7Q96M32 723 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 PHF14O94880 888 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.45■■□□□ 1.19
SPNS2-204ENST00000571386 IL13P35225 146 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 PIGBQ92521 554 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 KDRP35968 1356 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 KIF3CO14782 793 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 SMIM5Q71RC9 77 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 DCAF5Q96JK2 942 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 SSFA2P28290 1259 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS2-204ENST00000571386 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 WDR90Q96KV7 1748 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 SIK1P57059 783 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 CABP4P57796 275 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 HMOX1P09601 288 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 CFAP53Q96M91 514 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 PCNTO95613 3336 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 APLP1P51693 650 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 GNPATO15228 680 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 ATP6V1AP38606 617 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 ATG3Q9NT62 314 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS2-204ENST00000571386 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 C4AP0C0L4 1744 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 MMP10P09238 476 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 ITPK1Q13572 414 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 TOMM70O94826 608 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 BCS1LQ9Y276 419 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 NUDCQ9Y266 331 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS2-204ENST00000571386 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 PPP2R1AP30153 589 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 TGFB2P61812 414 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 A0A0G2JLW4 131 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 LGR6Q9HBX8 967 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 MRC1P22897 1456 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS2-204ENST00000571386 FCHSD2O94868 740 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 DPEP1P16444 411 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 SBF1O95248 1867 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 PRKAR2BP31323 418 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 ADRA2BP18089 450 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 HTRA3P83110 453 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 GYS1P13807 737 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS2-204ENST00000571386 TEFQ10587 303 aa22.16■■□□□ 1.14
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