RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569773.1

GDE1-204, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GDE1, Length 739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-204ENST00000569773 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 SPRYD7Q5W111 196 aa8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.97□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.96□□□□□ -0.97
GDE1-204ENST00000569773 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 MBD5Q9P267 1494 aa8.96□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 UCN2Q96RP3 112 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 NPATQ14207 1427 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 CEP162Q5TB80 1403 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 A2MP01023 1474 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.94□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 ZNF592Q92610 1267 aa8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 PTPRTO14522 1441 aa8.93□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 NCOA1Q15788 1441 aa8.92□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.92□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 PIK3CDO00329 1044 aa8.92□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 WNT7AO00755 349 aa8.92□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.92□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa8.91□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.91□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 FOXC1Q12948 553 aa8.91□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 ARID5BQ14865 1188 aa8.91□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.91□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 NCOA2Q15596 1464 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 PTPRKQ15262 1439 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 ZMYM3Q14202 1370 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 SIAH2O43255 324 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 GFRA3O60609 400 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.9□□□□□ -0.98
GDE1-204ENST00000569773 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.9□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 RNF135Q8IUD6 432 aa8.89□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.89□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.89□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 PLA2R1Q13018 1463 aa8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.88□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 SKIP12755 728 aa8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 RFX1P22670 979 aa8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 RAB15P59190 212 aa8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 CDK15Q96Q40 435 aa8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 MAP3K1Q13233 1512 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 ESPNB1AK53 854 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 TNFRSF10AO00220 468 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 ATP9BO43861 1147 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 FSHRP23945 695 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.86□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.85□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 GDF9O60383 454 aa8.85□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GDE1-204ENST00000569773 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms