RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 TEFQ10587 303 aa24.98■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 E9PSI1 815 aa24.97■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 SLFN5Q08AF3 891 aa24.97■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 GNAI1P63096 354 aa24.96■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 IFT57Q9NWB7 429 aa24.96■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 CFAP44Q96MT7 982 aa24.95■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.95■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 ZNF853P0CG23 659 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 NHSQ6T4R5 1651 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 PAPPAQ13219 1627 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 CABP4P57796 275 aa24.93■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.93■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.93■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.92■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 BTAF1O14981 1849 aa24.92■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 CHL1O00533 1208 aa24.91■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.91■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 BAG6P46379 1132 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 MBIPQ9NS73 344 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 BTBD11A6QL63 1104 aa24.89■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.89■■□□□ 1.58
CTU2-204ENST00000564105 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.88■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 CACNA1FO60840 1977 aa24.88■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 BCL9O00512 1426 aa24.88■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.88■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.86■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 TRIM37O94972 964 aa24.85■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 PIGBQ92521 554 aa24.84■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 C5P01031 1676 aa24.83■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 SLC39A6Q13433 755 aa24.83■■□□□ 1.57
CTU2-204ENST00000564105 KCNQ3O43525 872 aa24.81■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 KCNQ2O43526 872 aa24.81■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 ZNF790Q6PG37 636 aa24.81■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.81■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.8■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 LY75O60449 1722 aa24.78■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.78■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.78■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.77■■□□□ 1.56
CTU2-204ENST00000564105 KRT24Q2M2I5 525 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 ATG3Q9NT62 314 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 APBA3O96018 575 aa24.76■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 TSPYL6Q8N831 410 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 RREB1Q92766 1687 aa24.75■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 TJP1Q07157 1748 aa24.74■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 LRP5O75197 1615 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.73■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 VAMP4O75379 141 aa24.71■■□□□ 1.55
CTU2-204ENST00000564105 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 PALLDQ8WX93 1383 aa24.69■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 HOXB7P09629 217 aa24.67■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.67■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.66■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.66■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.65■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 ZNF428Q96B54 188 aa24.65■■□□□ 1.54
CTU2-204ENST00000564105 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CTU2-204ENST00000564105 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.63■■□□□ 1.53
CTU2-204ENST00000564105 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CTU2-204ENST00000564105 SIK1P57059 783 aa24.63■■□□□ 1.53
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