RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ITPK1	Q13572	414 aa		29.41	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		29.41	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		29.41	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K5	Q99683	1374 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CABP4	P57796	275 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V1A	P38606	617 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	AK7	Q96M32	723 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	POLD1	P28340	1107 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	MSH5	O43196	834 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R1A	P30153	589 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM5	Q71RC9	77 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	LGR6	Q9HBX8	967 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MRC1	P22897	1456 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SSFA2	P28290	1259 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MSL1	Q68DK7	614 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GNPAT	O15228	680 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF14	O94880	888 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP53	Q96M91	514 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PPP4C-205	ENST00000563200	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TJP1	Q07157	1748 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL34	Q8N239	644 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDC	Q9Y266	331 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAR2B	P31323	418 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS6KA4	O75676	772 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ADRA2B	P18089	450 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A6	Q13433	755 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	C4A	P0C0L4	1744 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	FCHSD2	O94868	740 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	YY1	P25490	414 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD4	Q14839	1912 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GYS1	P13807	737 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RFC4	P35249	363 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TEF	Q10587	303 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR162	Q16538	588 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP10	P09238	476 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF790	Q6PG37	636 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RALBP1	Q15311	655 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	29.03	■■■□□ 2.24	5e-9	■■□□□ 12.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MCM10	Q7L590	875 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD11	A6QL63	1104 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP8	Q14318	412 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNQ3	O43525	872 aa		28.96	■■■□□ 2.23

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