RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	SLAIN2	Q9P270	581 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	NUP155	O75694	1391 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	MSH6	P52701	1360 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	SYNM	O15061	1565 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	TBX22	Q9Y458	520 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PSMA4-208	ENST00000558639	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	TET3	O43151	1660 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	ADGRB3	O60242	1522 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	ATF3	P18847	181 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	ROCK1	Q13464	1354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	COPS2	P61201	443 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	ZFYVE9	O95405	1425 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PSMA4-208	ENST00000558639	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	NR6A1	Q15406	480 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	SPSB2	Q99619	263 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	PTPN5	P54829	565 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639		E9PCH4	1651 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	JUND	P17535	347 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	UNC13B	O14795	1591 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	PHLPP1	O60346	1717 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	PTPRN	Q16849	979 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	PIK3R4	Q99570	1358 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	IRF5	Q13568	498 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSMA4-208	ENST00000558639	ZPR1	O75312	459 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	BRINP3	Q76B58	766 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	MTR	Q99707	1265 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	PTPRU	Q92729	1446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	CTH	P32929	405 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	GLMN	Q92990	594 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	ADH1B	P00325	375 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	IL21	Q9HBE4	155 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	TRPM2	O94759	1503 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	MET	P08581	1390 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	RXRB	P28702	533 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	MMP16	P51512	607 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	RGL3	Q3MIN7	710 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	DIP2A	Q14689	1571 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	TLL1	O43897	1013 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	GPR37L1	O60883	481 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PSMA4-208	ENST00000558639	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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