RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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TMEM260-216ENST00000557657 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
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TMEM260-216ENST00000557657 ORAI2Q96SN7 254 aa26.19■■□□□ 1.78
TMEM260-216ENST00000557657 PDE1AP54750 535 aa26.19■■□□□ 1.78
TMEM260-216ENST00000557657 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.19■■□□□ 1.78
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TMEM260-216ENST00000557657 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.08■■□□□ 1.77
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TMEM260-216ENST00000557657 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TMEM260-216ENST00000557657 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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TMEM260-216ENST00000557657 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.01■■□□□ 1.75
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TMEM260-216ENST00000557657 SSH3Q8TE77 659 aa25.99■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.98■■□□□ 1.75
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TMEM260-216ENST00000557657 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.98■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 NEK4P51957 841 aa25.97■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 ST18O60284 1047 aa25.96■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 ADCY9O60503 1353 aa25.95■■□□□ 1.75
TMEM260-216ENST00000557657 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.95■■□□□ 1.74
TMEM260-216ENST00000557657 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TMEM260-216ENST00000557657 STAP2Q9UGK3 403 aa25.94■■□□□ 1.74
TMEM260-216ENST00000557657 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
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