RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557495.5

ZNF410-222, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 4

Gene ZNF410, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-222	ENST00000557495	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	PRKAR2B	P31323	418 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	RALBP1	Q15311	655 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	ATG3	Q9NT62	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-222	ENST00000557495	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	MRC1	P22897	1456 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	CABP4	P57796	275 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	SIK1	P57059	783 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	ITPK1	Q13572	414 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	TJP1	Q07157	1748 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	FCHSD2	O94868	740 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ZNF410-222	ENST00000557495	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	CCDC184	Q52MB2	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	PTGER2	P43116	358 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	MCM10	Q7L590	875 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	KCNQ3	O43525	872 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	PHF14	O94880	888 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	AK7	Q96M32	723 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	GNPAT	O15228	680 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	TEF	Q10587	303 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	NFE2L2	Q16236	605 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ZNF410-222	ENST00000557495	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	NEFM	P07197	916 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	SSFA2	P28290	1259 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	RIPK4	P57078	832 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ZNF410-222	ENST00000557495	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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