RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	SIK1	P57059	783 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	MRC1	P22897	1456 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	ANP32C	O43423	234 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	ITPK1	Q13572	414 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.09	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	MCM10	Q7L590	875 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TPCN1-222	ENST00000552897	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	NEFM	P07197	916 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	C5	P01031	1676 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	TEF	Q10587	303 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TPCN1-222	ENST00000552897	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	RUNDC1	Q96C34	613 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	KCNQ3	O43525	872 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.97	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.97	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	RIPK4	P57078	832 aa		31.96	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF790	Q6PG37	636 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	AK7	Q96M32	723 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TPCN1-222	ENST00000552897	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	TJP1	Q07157	1748 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	NEUROD2	Q15784	382 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	GNPAT	O15228	680 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	LRP5	O75197	1615 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TPCN1-222	ENST00000552897	PHF14	O94880	888 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	APAF1	O14727	1248 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	MSH5	O43196	834 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	PTGER2	P43116	358 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	SSFA2	P28290	1259 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TPCN1-222	ENST00000552897	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TPCN1-222	ENST00000552897	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TPCN1-222	ENST00000552897	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TPCN1-222	ENST00000552897	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TPCN1-222	ENST00000552897	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TPCN1-222	ENST00000552897	MSL1	Q68DK7	614 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TPCN1-222	ENST00000552897	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
TPCN1-222	ENST00000552897	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		31.77	■■■□□ 2.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms