RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545436.5

LMO3-232, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 530 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-232ENST00000545436 DCTN1Q14203 1278 aa16.08■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.08■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 PAPPAQ13219 1627 aa16.08■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa16.08■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 RXRBP28702 533 aa16.07■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 CABP4P57796 275 aa16.07■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 LGR6Q9HBX8 967 aa16.07■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.07■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 ITGB4P16144 1822 aa16.07■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 BTBD11A6QL63 1104 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 MBIPQ9NS73 344 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 CACNA1FO60840 1977 aa16.06■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.05■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.05■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 NHSQ6T4R5 1651 aa16.05■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 A0A0G2JS52 829 aa16.04■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 MYT1Q01538 1121 aa16.04■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 ZNF790Q6PG37 636 aa16.03■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.03■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.03■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.02■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LMO3-232ENST00000545436 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 SBF2Q86WG5 1849 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.01■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 FMNL2Q96PY5 1086 aa16■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 RCAN3Q9UKA8 241 aa16■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.99■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 RGS12O14924 1447 aa15.98■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 ERBB4Q15303 1308 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 VAMP4O75379 141 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 PIGBQ92521 554 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 KIF16BQ96L93 1317 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 POTEAQ6S8J7 498 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO3-232ENST00000545436 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 BTAF1O14981 1849 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 MS4A1P11836 297 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 MIS18AQ9NYP9 233 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 STK31Q9BXU1 1019 aa15.93■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 ATG3Q9NT62 314 aa15.93■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.92■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 LY75O60449 1722 aa15.91■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.91■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 PTPRCP08575 1304 aa15.91■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 PALLDQ8WX93 1383 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 C5P01031 1676 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 STARD3NLO95772 234 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 SLC39A6Q13433 755 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 TSPYL6Q8N831 410 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.9■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LMO3-232ENST00000545436 KCNQ3O43525 872 aa15.89■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.89■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.89■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.89■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 HYPKQ9NX55 129 aa15.88■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 SIK1P57059 783 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 PDE3AQ14432 1141 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 TJP1Q07157 1748 aa15.87■□□□□ 0.13
LMO3-232ENST00000545436 RREB1Q92766 1687 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms