RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 ITGB4P16144 1822 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-210ENST00000533686 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 DCTN1Q14203 1278 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 NEUROD2Q15784 382 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 BTAF1O14981 1849 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 ATG3Q9NT62 314 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC27Q2M243 656 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 PROM2Q8N271 834 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 NGEFQ8N5V2 710 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 PALLDQ8WX93 1383 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 TXNRD1Q16881 649 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-210ENST00000533686 BTBD11A6QL63 1104 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 SIK1P57059 783 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC39A6Q13433 755 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF790Q6PG37 636 aa21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 LY75O60449 1722 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 WWC1Q8IX03 1113 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PACSIN3-210ENST00000533686 PAPPAQ13219 1627 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 RREB1Q92766 1687 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 CHL1O00533 1208 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 ATP6V1AP38606 617 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 CFAP44Q96MT7 982 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNQ3O43525 872 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 WDR63Q8IWG1 891 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 IFT57Q9NWB7 429 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 IL16Q14005 1332 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.49■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF853P0CG23 659 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNQ4P56696 695 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 GNAI1P63096 354 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 ITPK1Q13572 414 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 NBPF14Q5TI25 921 aa21.47■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.46■■□□□ 1.03
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF521Q96K83 1311 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.45■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 AKT1S1Q96B36 256 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 STK32BQ9NY57 414 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC15A2Q16348 729 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 MBIPQ9NS73 344 aa21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 STARD3NLO95772 234 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF827Q17R98 1081 aa21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3-210ENST00000533686 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 C5P01031 1676 aa21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 AK7Q96M32 723 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 TJP1Q07157 1748 aa21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 GOLGA2Q08379 1002 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 USP16Q9Y5T5 823 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 C4BP0C0L5 1744 aa21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.36■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 HOXB7P09629 217 aa21.35■■□□□ 1.01
PACSIN3-210ENST00000533686 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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