RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 PPP2R1AP30153 589 aa35.89■■■■□ 3.34
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RPS6KA1-212ENST00000526040 AK7Q96M32 723 aa35.88■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 ITPK1Q13572 414 aa35.87■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa35.87■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 FLAD1Q8NFF5 587 aa35.87■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 POLD1P28340 1107 aa35.86■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 UBR3Q6ZT12 1888 aa35.84■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 SYT17Q9BSW7 474 aa35.83■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 LGR6Q9HBX8 967 aa35.83■■■■□ 3.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC4A9Q96Q91 983 aa35.82■■■■□ 3.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF831Q5JPB2 1677 aa35.81■■■■□ 3.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 RNMTO43148 476 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 AMIGO3Q86WK7 504 aa35.8■■■■□ 3.32
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RPS6KA1-212ENST00000526040 DCAF8L1A6NGE4 600 aa35.78■■■■□ 3.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC52A2Q9HAB3 445 aa35.78■■■■□ 3.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 PHF14O94880 888 aa35.77■■■■□ 3.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 SMIM5Q71RC9 77 aa35.77■■■■□ 3.32
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RPS6KA1-212ENST00000526040 SSFA2P28290 1259 aa35.76■■■■□ 3.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 GNPATO15228 680 aa35.75■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 MSL1Q68DK7 614 aa35.75■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa35.74■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAP3K5Q99683 1374 aa35.74■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 GAS2L2Q8NHY3 880 aa35.73■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35.72■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 MRC1P22897 1456 aa35.72■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRKAR2BP31323 418 aa35.71■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 KLHL34Q8N239 644 aa35.71■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.7■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.68■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa35.67■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.67■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 FCHSD2O94868 740 aa35.65■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC39A6Q13433 755 aa35.65■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 TRAPPC3LQ5T215 181 aa35.65■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 TJP1Q07157 1748 aa35.64■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 IL17REQ8NFR9 667 aa35.64■■■■□ 3.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 RPS6KA4O75676 772 aa35.63■■■■□ 3.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADRA2BP18089 450 aa35.59■■■■□ 3.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 CRKLP46109 303 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 TEFQ10587 303 aa35.58■■■■□ 3.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 RALBP1Q15311 655 aa35.57■■■■□ 3.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 DNAJC10Q8IXB1 793 aa35.57■■■■□ 3.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 KCPQ6ZWJ8 1503 aa35.57■■■■□ 3.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 NLGN2Q8NFZ4 835 aa35.56■■■■□ 3.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 RFC4P35249 363 aa35.54■■■■□ 3.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 UBR2Q8IWV8 1755 aa35.53■■■■□ 3.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 TTC5Q8N0Z6 440 aa35.53■■■■□ 3.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa35.52■■■■□ 3.28
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RPS6KA1-212ENST00000526040 C4AP0C0L4 1744 aa35.51■■■■□ 3.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 NLGN1Q8N2Q7 840 aa35.5■■■■□ 3.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC87Q9NVE4 849 aa35.5■■■■□ 3.27
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RPS6KA1-212ENST00000526040 YY1P25490 414 aa35.49■■■■□ 3.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
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RPS6KA1-212ENST00000526040 MMP10P09238 476 aa35.46■■■■□ 3.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 GYS1P13807 737 aa35.46■■■■□ 3.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
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RPS6KA1-212ENST00000526040 PLEKHF1Q96S99 279 aa35.43■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 HEG1Q9ULI3 1381 aa35.41■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
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RPS6KA1-212ENST00000526040 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa35.41■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.41■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 CHD4Q14839 1912 aa35.4■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 FMNL2Q96PY5 1086 aa35.4■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 KCNQ3O43525 872 aa35.39■■■■□ 3.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 STARD3NLO95772 234 aa35.39■■■■□ 3.26
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