RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523213.1

ZBED8-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED8, Length 2,484 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-202ENST00000523213 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 ERBB3P21860 1342 aa18.44■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 KIF1AQ12756 1690 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 ALS2Q96Q42 1657 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 BTBD11A6QL63 1104 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 DCTPP1Q9H773 170 aa18.43■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.42■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.41■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
ZBED8-202ENST00000523213 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.39■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 BRINP3Q76B58 766 aa18.39■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.39■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.39■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.38■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.38■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 NCAPD2Q15021 1401 aa18.38■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 SLC39A6Q13433 755 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 PROSER3Q2NL68 480 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.37■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 STRCQ7RTU9 1775 aa18.36■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 DCCP43146 1447 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 USP44Q9H0E7 712 aa18.35■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 GNAI2P04899 355 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 MEGF6O75095 1541 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.34■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.33■□□□□ 0.53
ZBED8-202ENST00000523213 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.33■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 COL18A1P39060 1754 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 SLAIN2Q9P270 581 aa18.32■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.31■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 PHKG2P15735 406 aa18.3■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 CYP27B1O15528 508 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 TTC22Q5TAA0 569 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 ADCY9O60503 1353 aa18.29■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 CACNA1FO60840 1977 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 GNAI3P08754 354 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 HMMRO75330 724 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.28■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 ATP8B2P98198 1209 aa18.27■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 BEND3Q5T5X7 828 aa18.27■□□□□ 0.52
ZBED8-202ENST00000523213 NFKBIBQ15653 356 aa18.27■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.27■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 HOXB7P09629 217 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 SDSP20132 328 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 BECN1Q14457 450 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 ZNF790Q6PG37 636 aa18.26■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.25■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 MYL6BP14649 208 aa18.25■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 SPG7Q9UQ90 795 aa18.25■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.25■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 CDC45O75419 566 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 PDIA6Q15084 440 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.24■□□□□ 0.51
ZBED8-202ENST00000523213 KIF2CQ99661 725 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms