RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523133.1

MSC-AS1-209, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 494 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-209ENST00000523133 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 DIP2AQ14689 1571 aa6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 REREQ9P2R6 1566 aa6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 C6orf229H3BNL8 230 aa6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 SIAH2O43255 324 aa6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 LCE2CQ5TA81 110 aa6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 SLAIN2Q9P270 581 aa6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 TIAM1Q13009 1591 aa6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 MSH6P52701 1360 aa6.69□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 ATRNO75882 1429 aa6.68□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 ATP10DQ9P241 1426 aa6.68□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 MYOM1P52179 1685 aa6.68□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 KCNQ2O43526 872 aa6.68□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 WDR90Q96KV7 1748 aa6.67□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 SH3BP2P78314 561 aa6.67□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 KLRG1Q96E93 195 aa6.67□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 ALDH1A1P00352 501 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 MS4A1P11836 297 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 HTRA3P83110 453 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 PRR7Q8TB68 274 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 ATP7AQ04656 1500 aa6.66□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 WFS1O76024 890 aa6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 GPR162Q16538 588 aa6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 PTPRNQ16849 979 aa6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 JMYQ8N9B5 988 aa6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 TRIM47Q96LD4 638 aa6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.65□□□□□ -1.34
MSC-AS1-209ENST00000523133 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.65□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.65□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 DLC1Q96QB1 1528 aa6.65□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 MTMR2Q13614 643 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 LINC01559Q495D7 138 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 BAP1Q92560 729 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.64□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 TRIM66O15016 1216 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 BMP1P13497 986 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.63□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 TNRQ92752 1358 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 CFAP99D6REC4 459 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 KCNH2Q12809 1159 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 A2MP01023 1474 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 CCER2I3L3R5 266 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 DESI1Q6ICB0 168 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 ZNF511Q8NB15 262 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 SENP2Q9HC62 589 aa6.61□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 PRXQ9BXM0 1461 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 NEFLP07196 543 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 SYT17Q9BSW7 474 aa6.6□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 SPTLC1O15269 473 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 GJA5P36382 358 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 LYPD8Q6UX82 237 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 CACNA1AO00555 2505 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 ADGRB2O60241 1585 aa6.59□□□□□ -1.35
MSC-AS1-209ENST00000523133 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.58□□□□□ -1.36
MSC-AS1-209ENST00000523133 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MSC-AS1-209ENST00000523133 WIPF1O43516 503 aa6.58□□□□□ -1.36
MSC-AS1-209ENST00000523133 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
MSC-AS1-209ENST00000523133 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.58□□□□□ -1.36
MSC-AS1-209ENST00000523133 AFAP1Q8N556 730 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms