RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 NFKBIBQ15653 356 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CASC1Q6TDU7 716 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 G2E3Q7L622 706 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 MEIS3Q99687 375 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 FLIIQ13045 1269 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 GCC1Q96CN9 775 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF853P0CG23 659 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 TICAM2Q86XR7 235 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 LGR6Q9HBX8 967 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM94Q12767 1356 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 IL17REQ8NFR9 667 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 MSH6P52701 1360 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SHPRHQ149N8 1683 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF10O15013 1369 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 DIP2AQ14689 1571 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SLIT1O75093 1534 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K5Q99683 1374 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SEC24BO95487 1268 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 GNAI2P04899 355 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 MMP14P50281 582 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 FAM193AP78312 1265 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 GNAI3P08754 354 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 PTMSP20962 102 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 DMTNQ08495 405 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 TAF3Q5VWG9 929 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRCP08575 1304 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 USP31Q70CQ4 1352 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 KIF20AO95235 890 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 MYL6BP14649 208 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 HSCBQ8IWL3 235 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ITSN1Q15811 1721 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SMC5Q8IY18 1101 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SPG7Q9UQ90 795 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SLC39A6Q13433 755 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 RILPL2Q969X0 211 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 KCNQ3O43525 872 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 NUCB1Q02818 461 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.872e-8■□□□□ 10.5
TRPS1-208ENST00000519076 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 APPP05067 770 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 CABP4P57796 275 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC4O15439 1325 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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