RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516552.1

RNU6-118P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 118, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-118P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 THBS3P49746 956 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 MAPK7Q13164 816 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 INF2Q27J81 1249 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 MST1LQ2TV78 715 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 EPHA10Q5JZY3 1008 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 FBXL22Q6P050 247 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SLAIN1Q8ND83 568 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SIMC1Q8NDZ2 872 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 NKX2-3Q8TAU0 364 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ADGRE3Q9BY15 652 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 LMCD1Q9NZU5 365 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZIM2Q9NZV7 527 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ITGB4P16144 1822 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 AGRNO00468 2067 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SORL1Q92673 2214 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ATRXP46100 2492 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ATRNL1Q5VV63 1379 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 CARNS1A5YM72 827 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 WNT11O96014 354 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SLPIP03973 132 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 DSG3P32926 999 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 TIE1P35590 1138 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 NBPF20Q3BBV1 942 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 NAALADL2Q58DX5 795 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 CYB5RLQ6IPT4 315 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 LCNL1Q6ZST4 164 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 OAFQ86UD1 273 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 WFDC3Q8IUB2 231 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 OSCARQ8IYS5 282 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 GAS2L2Q8NHY3 880 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PANK1Q8TE04 598 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SLC39A7Q92504 469 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SHISA4Q96DD7 197 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF414Q96IQ9 312 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SERGEFQ9UGK8 458 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ERBB4Q15303 1308 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 KRBA1A5PL33 1030 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 MEGF11A6BM72 1044 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SRRM5B3KS81 715 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 DGAT1O75907 488 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 FUT4P22083 530 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PLAURQ03405 335 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF124Q15973 351 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ADAM2Q99965 735 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 RTN4RQ9BZR6 473 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 MYRFQ9Y2G1 1151 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 WASF2Q9Y6W5 498 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 BRWD3Q6RI45 1802 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-118P-201ENST00000516552 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 H3BM21 787 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 CCDC188H7C350 402 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 ST8SIA5O15466 376 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 FSHBP01225 129 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 ARL14EPLP0DKL9 152 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 E2F1Q01094 437 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM69CQ0P6D2 419 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 COL19A1Q14993 1142 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 RGL3Q3MIN7 710 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 IGFL4Q6B9Z1 124 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 TCF24Q7RTU0 167 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 SIAH1Q8IUQ4 282 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-118P-201ENST00000516552 C20orf173Q96LM9 149 aa-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms