RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515209.5

LMAN2-208, Transcript of lectin, mannose binding 2, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene LMAN2, Length 1,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMAN2-208	ENST00000515209	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	C4B	P0C0L5	1744 aa		32	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	AKT1S1	Q96B36	256 aa		31.99	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	ATG3	Q9NT62	314 aa		31.99	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	CABP4	P57796	275 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	LGR6	Q9HBX8	967 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.96	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		31.95	■■■□□ 2.71
LMAN2-208	ENST00000515209	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		31.95	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		31.94	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		31.93	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.93	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	SIK1	P57059	783 aa		31.93	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	TJP1	Q07157	1748 aa		31.92	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		31.92	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		31.92	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.9	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
LMAN2-208	ENST00000515209	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		31.88	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		31.88	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		31.87	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	ITPK1	Q13572	414 aa		31.86	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		31.85	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.84	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	ATP6V1A	P38606	617 aa		31.83	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		31.83	■■■□□ 2.69
LMAN2-208	ENST00000515209	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	NEFM	P07197	916 aa		31.79	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.79	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	TEF	Q10587	303 aa		31.78	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		31.77	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	SLC39A6	Q13433	755 aa		31.77	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	NFE2L2	Q16236	605 aa		31.77	■■■□□ 2.68
LMAN2-208	ENST00000515209	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	31.76	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	AK7	Q96M32	723 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	MTFR1L	Q9H019	292 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	MCM10	Q7L590	875 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		31.74	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		31.74	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		31.73	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		31.73	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	C4A	P0C0L4	1744 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	ANP32C	O43423	234 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	PTGER2	P43116	358 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	DCTN1	Q14203	1278 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	SSFA2	P28290	1259 aa		31.7	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	ZNF790	Q6PG37	636 aa		31.7	■■■□□ 2.67
LMAN2-208	ENST00000515209	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	GNPAT	O15228	680 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	RUNDC1	Q96C34	613 aa		31.67	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		31.66	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	SMIM5	Q71RC9	77 aa		31.64	■■■□□ 2.66
LMAN2-208	ENST00000515209	PHF14	O94880	888 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	KCNQ3	O43525	872 aa		31.62	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.62	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		31.61	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	RIPK4	P57078	832 aa		31.61	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	MSH5	O43196	834 aa		31.6	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	ADRA2B	P18089	450 aa		31.6	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.6	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		31.58	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		31.58	■■■□□ 2.65
LMAN2-208	ENST00000515209	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
LMAN2-208	ENST00000515209	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
LMAN2-208	ENST00000515209	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.56	■■■□□ 2.64
LMAN2-208	ENST00000515209	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
LMAN2-208	ENST00000515209	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.54	■■■□□ 2.64
LMAN2-208	ENST00000515209	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
LMAN2-208	ENST00000515209	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
LMAN2-208	ENST00000515209	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		31.54	■■■□□ 2.64

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