RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EYA1Q99502 592 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF3CO14782 793 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ITPK1Q13572 414 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMIM5Q71RC9 77 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BCS1LQ9Y276 419 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PXDNLA1KZ92 1463 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ERVV-2B6SEH9 535 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TOMM70O94826 608 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RFC4P35249 363 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATG3Q9NT62 314 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DCAF5Q96JK2 942 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C10orf71Q711Q0 1435 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF13BQ9NQT8 1826 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FCHSD2O94868 740 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLKQ9UBT6 870 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KDRP35968 1356 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A0G2JLW4 131 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPS6KA4O75676 772 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CABP4P57796 275 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C4AP0C0L4 1744 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GYS1P13807 737 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DPEP1P16444 411 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PIM2Q9P1W9 311 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MTHFSP49914 203 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FSTL1Q12841 308 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C9orf131Q5VYM1 1079 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NMRK2Q9NPI5 230 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CRKLP46109 303 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF181Q9P0P0 153 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZPR1O75312 459 aa12.67□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCNA3P22001 575 aa12.67□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR90Q96KV7 1748 aa12.67□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FKBP8Q14318 412 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KLRG1Q96E93 195 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MORC1Q86VD1 984 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMC1BQ8NDV3 1235 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDR1Q08345 913 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 JMYQ8N9B5 988 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PANK3Q9H999 370 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RRAGCQ9HB90 399 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TM4SF1P30408 202 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHRNA5P30532 468 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TJP1Q07157 1748 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LMNB1P20700 586 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KNSTRNQ9Y448 316 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DNAJC10Q8IXB1 793 aa12.6□□□□□ -0.39
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTLL6Q8N841 843 aa12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms