RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP53Q96M91 514 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGER2P43116 358 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SIK1P57059 783 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 ITPK1Q13572 414 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 LGR6Q9HBX8 967 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 CABP4P57796 275 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 MTFR1LQ9H019 292 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K5Q99683 1374 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAR2BP31323 418 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM5Q71RC9 77 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V1AP38606 617 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 AK7Q96M32 723 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDCQ9Y266 331 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF14O94880 888 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A6Q13433 755 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 MSL1Q68DK7 614 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-218ENST00000511185 MSH5O43196 834 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 RALBP1Q15311 655 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 GNPATO15228 680 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 IL17REQ8NFR9 667 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 FCHSD2O94868 740 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ARXQ96QS3 562 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-218ENST00000511185 SSFA2P28290 1259 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 MCM10Q7L590 875 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 DCTN1Q14203 1278 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SCN7AQ01118 1682 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 POLD1P28340 1107 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TEFQ10587 303 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL34Q8N239 644 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT17Q9BSW7 474 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-218ENST00000511185 BCORQ6W2J9 1755 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNQ3O43525 872 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF790Q6PG37 636 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 UTRNP46939 3433 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS6KA4O75676 772 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 CHD4Q14839 1912 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-218ENST00000511185 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.83■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 BTBD11A6QL63 1104 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NFE2L2Q16236 605 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-218ENST00000511185 COL15A1P39059 1388 aa24.81■■□□□ 1.56
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