RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 IP6K1Q92551 441 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 POTECB2RU33 542 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 GNPATO15228 680 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 NME9Q86XW9 330 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 ITGB4P16144 1822 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 VEGFBP49765 207 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 EVC2Q86UK5 1308 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 RASSF7Q02833 373 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2B-207ENST00000510021 TMF1P82094 1093 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 CHADLQ6NUI6 762 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 LMNB1P20700 586 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 SIK1P57059 783 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 ITPK1Q13572 414 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 PASKQ96RG2 1323 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.14■■□□□ 1.14
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 GYS1P13807 737 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 PIGBQ92521 554 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 POTEIP0CG38 1075 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 POTEJP0CG39 1038 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 CHRNA5P30532 468 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 HOXC9P31274 260 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 CFAP44Q96MT7 982 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 NBPF4Q96M43 638 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 CYP27B1O15528 508 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2B-207ENST00000510021 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 ATP6V1AP38606 617 aa22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 ADRA2BP18089 450 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.06■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 RASSF10A6NK89 507 aa22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.03■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 RFC4P35249 363 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 DDR1Q08345 913 aa22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
UBE2B-207ENST00000510021 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.02■■□□□ 1.12
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UBE2B-207ENST00000510021 AMPHP49418 695 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 KDRP35968 1356 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 DEFB115Q30KQ5 88 aa22■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 LDHDQ86WU2 507 aa21.99■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 RTL1A6NKG5 1358 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.98■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 RPS6KA4O75676 772 aa21.96■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 FBLN1P23142 703 aa21.96■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.96■■□□□ 1.11
UBE2B-207ENST00000510021 FKBP8Q14318 412 aa21.95■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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UBE2B-207ENST00000510021 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 ATG3Q9NT62 314 aa21.94■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.94■■□□□ 1.1
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UBE2B-207ENST00000510021 SCN4AP35499 1836 aa21.92■■□□□ 1.1
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UBE2B-207ENST00000510021 ERFEQ4G0M1 354 aa21.92■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 A0A1W2PP64 1363 aa21.91■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 TTLL6Q8N841 843 aa21.91■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 TSKSQ9UJT2 592 aa21.91■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.9■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.9■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
UBE2B-207ENST00000510021 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.89■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.89■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 TMC1Q8TDI8 760 aa21.88■■□□□ 1.09
UBE2B-207ENST00000510021 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.88■■□□□ 1.09
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