RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 EHBP1Q8NDI1 1231 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 GAS2L2Q8NHY3 880 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 CEP126Q9P2H0 1117 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L15C9J2P7 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L10C9JJH3 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L13C9JLJ4 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L12C9JPN9 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L11C9JVI0 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L21D6R901 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L18D6R9N7 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L22D6RA61 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L17D6RBQ6 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L19D6RCP7 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L20D6RJB6 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 FSHRP23945 695 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L24Q0WX57 530 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 NBPF14Q5TI25 921 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB33Q86T24 672 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1024Q9UPX6 916 aa3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L5A8MUK1 530 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ATP1A2P50993 1020 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 NCOA4Q13772 614 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 PHTF2Q8N3S3 785 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 TCF3P15923 654 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SCNN1AP37088 669 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 MARSP56192 900 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 PTK7Q13308 1070 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 DRC1Q96MC2 740 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 BCL2L13Q9BXK5 485 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 USP35Q9P2H5 1018 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 PTK2Q05397 1052 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 FAM69CQ0P6D2 419 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ANKMY2Q8IV38 441 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SKIP12755 728 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 LARGE2Q8N3Y3 721 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ERVH48-1M5A8F1 160 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ALDH1A1P00352 501 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ATP2B4P23634 1241 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CLDN10P78369 228 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ADD1P35611 737 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 WNT7BP56706 349 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 EML3Q32P44 896 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SLFNL1Q499Z3 407 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 TAS1R3Q7RTX0 852 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 STK32AQ8WU08 396 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM52Q96A61 297 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 COL26A1Q96A83 441 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ITPKCQ96DU7 683 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SLC10A4Q96EP9 437 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CBLBQ13191 982 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 NPAS4Q8IUM7 802 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SIX5Q8N196 739 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 PLPP7Q8NBV4 271 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 HPS1Q92902 700 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ZFAND3Q9H8U3 227 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SLAIN2Q9P270 581 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 PHF20L1A8MW92 1017 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 M0R2N6 131 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 WNT7AO00755 349 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 OXLD1Q5BKU9 147 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 CYLDQ9NQC7 956 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ESPNB1AK53 854 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 SMPD1P17405 629 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 RASA1P20936 1047 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 UBXN4Q92575 508 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ASB16Q96NS5 453 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 RAB6BQ9NRW1 208 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 NOD1Q9Y239 953 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 ADH1CP00326 375 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-218ENST00000509368 VARSP26640 1264 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms