RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 ATP6V1AP38606 617 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 SMIM5Q71RC9 77 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 MSL1Q68DK7 614 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRU-207ENST00000492954 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 MAP3K5Q99683 1374 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 PHF14O94880 888 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 KLHL34Q8N239 644 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 GNPATO15228 680 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 UTRNP46939 3433 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 SSFA2P28290 1259 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 LGR6Q9HBX8 967 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRU-207ENST00000492954 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 PPP2R1AP30153 589 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 CFAP53Q96M91 514 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 YY1P25490 414 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 MRC1P22897 1456 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRU-207ENST00000492954 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 PRKAR2BP31323 418 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 SLC39A6Q13433 755 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 NUDCQ9Y266 331 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 RPS6KA4O75676 772 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 GPR162Q16538 588 aa24.16■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRU-207ENST00000492954 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 ADRA2BP18089 450 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 TJP1Q07157 1748 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 IL17REQ8NFR9 667 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.13■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 RFC4P35249 363 aa24.11■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 MMP10P09238 476 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 TEFQ10587 303 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 FCHSD2O94868 740 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 GYS1P13807 737 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRU-207ENST00000492954 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 C4AP0C0L4 1744 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF790Q6PG37 636 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRU-207ENST00000492954 FKBP8Q14318 412 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 GRIN3BO60391 1043 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 MCM10Q7L590 875 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 WWC3Q9ULE0 1092 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 HEG1Q9ULI3 1381 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 KCNQ3O43525 872 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 BTBD11A6QL63 1104 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 STARD3NLO95772 234 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 DCTN1Q14203 1278 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 COL15A1P39059 1388 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-207ENST00000492954 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.98■■□□□ 1.43
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