RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.622e-7■■□□□ 13.6
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NELFE-211ENST00000492185 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 MEGF6O75095 1541 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 GCC1Q96CN9 775 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 TEFQ10587 303 aa25.14■■□□□ 1.62
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NELFE-211ENST00000492185 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.13■■□□□ 1.61
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NELFE-211ENST00000492185 CHRNA2Q15822 529 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-211ENST00000492185 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFE-211ENST00000492185 BTBD11A6QL63 1104 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFE-211ENST00000492185 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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NELFE-211ENST00000492185 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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NELFE-211ENST00000492185 DCTPP1Q9H773 170 aa25.06■■□□□ 1.6
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NELFE-211ENST00000492185 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 NECTIN2Q92692 538 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 LNPKQ9C0E8 428 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-211ENST00000492185 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 CYP27B1O15528 508 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 SEC24BO95487 1268 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.99■■□□□ 1.59
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NELFE-211ENST00000492185 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
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NELFE-211ENST00000492185 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.98■■□□□ 1.59
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NELFE-211ENST00000492185 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.96■■□□□ 1.59
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NELFE-211ENST00000492185 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.95■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.95■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.95■■□□□ 1.59
NELFE-211ENST00000492185 ZNF790Q6PG37 636 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFE-211ENST00000492185 GLI3P10071 1580 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-211ENST00000492185 ADCY9O60503 1353 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-211ENST00000492185 HMMRO75330 724 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-211ENST00000492185 USP44Q9H0E7 712 aa24.93■■□□□ 1.58
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NELFE-211ENST00000492185 BEND3Q5T5X7 828 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-211ENST00000492185 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-211ENST00000492185 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-211ENST00000492185 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-211ENST00000492185 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.9■■□□□ 1.58
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NELFE-211ENST00000492185 HYPKQ9NX55 129 aa24.9■■□□□ 1.58
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NELFE-211ENST00000492185 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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NELFE-211ENST00000492185 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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NELFE-211ENST00000492185 PDIA6Q15084 440 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 PROSER3Q2NL68 480 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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NELFE-211ENST00000492185 SLC39A6Q13433 755 aa24.88■■□□□ 1.57
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