RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490639.5

CP-212, Transcript of ceruloplasmin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CP, Length 3,105 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CP-212ENST00000490639 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.14□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 MCM10Q7L590 875 aa7.14□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.14□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.14□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.14□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 IL17REQ8NFR9 667 aa7.14□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 ZNF521Q96K83 1311 aa7.13□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 NEFMP07197 916 aa7.13□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.13□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 WWC1Q8IX03 1113 aa7.13□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 BCL9O00512 1426 aa7.13□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 RNMTO43148 476 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 PDE3BQ13370 1112 aa7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 CCDC27Q2M243 656 aa7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 LY75O60449 1722 aa7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 C5P01031 1676 aa7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 DCAF5Q96JK2 942 aa7.12□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.11□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 TAF1LQ8IZX4 1826 aa7.11□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 KCNQ2O43526 872 aa7.11□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 TJP1Q07157 1748 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.1□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 LAMB4A4D0S4 1761 aa7.09□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 PIGBQ92521 554 aa7.09□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.09□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.09□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 ZNF853P0CG23 659 aa7.09□□□□□ -1.27
CP-212ENST00000490639 CABP4P57796 275 aa7.08□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.08□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 WDR63Q8IWG1 891 aa7.08□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 NGEFQ8N5V2 710 aa7.08□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 KCNQ3O43525 872 aa7.08□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 ILDR2Q71H61 639 aa7.08□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TRIM37O94972 964 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TEFQ10587 303 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 SLC39A6Q13433 755 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 CFAP44Q96MT7 982 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 MBIPQ9NS73 344 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 RREB1Q92766 1687 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 IL16Q14005 1332 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 BTBD11A6QL63 1104 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 CHL1O00533 1208 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 IFT57Q9NWB7 429 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 GOLGA2Q08379 1002 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 SLFN5Q08AF3 891 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 ATG3Q9NT62 314 aa7.07□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 CACNA1FO60840 1977 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 KRT24Q2M2I5 525 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 ZNF790Q6PG37 636 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.06□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 GNAI1P63096 354 aa7.05□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.05□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.05□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 PALLDQ8WX93 1383 aa7.05□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 E9PSI1 815 aa7.05□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.05□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.04□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 TSPYL6Q8N831 410 aa7.04□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 C4BP0C0L5 1744 aa7.04□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.04□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.04□□□□□ -1.28
CP-212ENST00000490639 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms