RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 MTFR1LQ9H019 292 aa32.54■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 RSPH6AQ9H0K4 717 aa32.53■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa32.53■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa32.52■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 RNMTO43148 476 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 PRKAR2BP31323 418 aa32.51■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 FLAD1Q8NFF5 587 aa32.51■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB7AO95365 584 aa32.5■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 SLC52A2Q9HAB3 445 aa32.5■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 C4BP0C0L5 1744 aa32.5■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa32.5■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 ATP6V1AP38606 617 aa32.49■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 MRC1P22897 1456 aa32.48■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 GNAT3A8MTJ3 354 aa32.48■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 MAP3K5Q99683 1374 aa32.47■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 LGR6Q9HBX8 967 aa32.47■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 AK7Q96M32 723 aa32.46■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
EHD1-211ENST00000489379 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 NEFMP07197 916 aa32.43■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 PHACTR3Q96KR7 559 aa32.43■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 UBR3Q6ZT12 1888 aa32.43■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 PTGER2P43116 358 aa32.42■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 COL24A1Q17RW2 1714 aa32.41■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 ITPK1Q13572 414 aa32.41■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 LINC00116Q8NCU8 138 aa32.41■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 SGIP1Q9BQI5 828 aa32.39■■■□□ 2.78
EHD1-211ENST00000489379 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 SSFA2P28290 1259 aa32.38■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 TEFQ10587 303 aa32.38■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 MSH5O43196 834 aa32.37■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 IL17REQ8NFR9 667 aa32.37■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 SLC4A9Q96Q91 983 aa32.37■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa32.35■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 POLD1P28340 1107 aa32.35■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa32.34■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
EHD1-211ENST00000489379 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 GNPATO15228 680 aa32.32■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 ARXQ96QS3 562 aa32.31■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 UBR2Q8IWV8 1755 aa32.3■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 TTC5Q8N0Z6 440 aa32.3■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 VSIG10Q8N0Z9 540 aa32.3■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHF1Q96S99 279 aa32.3■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 TJP1Q07157 1748 aa32.29■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 ADRA2BP18089 450 aa32.29■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 SLC39A6Q13433 755 aa32.29■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 DLG5Q8TDM6 1919 aa32.28■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa32.27■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 KCPQ6ZWJ8 1503 aa32.27■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 PHF14O94880 888 aa32.27■■■□□ 2.76
EHD1-211ENST00000489379 RPS6KA4O75676 772 aa32.26■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 TRAPPC3LQ5T215 181 aa32.25■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 ZNF790Q6PG37 636 aa32.25■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 AMIGO3Q86WK7 504 aa32.25■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 CRKLP46109 303 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 NFE2L2Q16236 605 aa32.23■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 BTBD11A6QL63 1104 aa32.21■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 DNAJC10Q8IXB1 793 aa32.21■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 MCM10Q7L590 875 aa32.2■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 SYT17Q9BSW7 474 aa32.2■■■□□ 2.75
EHD1-211ENST00000489379 DCAF8L1A6NGE4 600 aa32.19■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 FMNL2Q96PY5 1086 aa32.18■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 CCDC87Q9NVE4 849 aa32.18■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 MSL1Q68DK7 614 aa32.17■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 HEG1Q9ULI3 1381 aa32.17■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 STARD3NLO95772 234 aa32.16■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 RFC4P35249 363 aa32.16■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 SMIM5Q71RC9 77 aa32.16■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 DCTN1Q14203 1278 aa32.14■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 NLGN1Q8N2Q7 840 aa32.14■■■□□ 2.74
EHD1-211ENST00000489379 C4AP0C0L4 1744 aa32.13■■■□□ 2.73
EHD1-211ENST00000489379 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
EHD1-211ENST00000489379 LMOD3Q0VAK6 560 aa32.11■■■□□ 2.73
EHD1-211ENST00000489379 RUNDC1Q96C34 613 aa32.1■■■□□ 2.73
EHD1-211ENST00000489379 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
EHD1-211ENST00000489379 TMPOP42166 694 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
EHD1-211ENST00000489379 RIPK4P57078 832 aa32.08■■■□□ 2.73
EHD1-211ENST00000489379 ADAMTS8Q9UP79 889 aa32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms