RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 PRKAR2BP31323 418 aa35.77■■■■□ 3.32
CCZ1B-211ENST00000486840 PAPPAQ13219 1627 aa35.76■■■■□ 3.32
CCZ1B-211ENST00000486840 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
CCZ1B-211ENST00000486840 FCHSD2O94868 740 aa35.74■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.73■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 RNMTO43148 476 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 POLD1P28340 1107 aa35.73■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa35.73■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC52A2Q9HAB3 445 aa35.72■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 DCAF8L1A6NGE4 600 aa35.71■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 LGR6Q9HBX8 967 aa35.71■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35.7■■■■□ 3.31
CCZ1B-211ENST00000486840 TEFQ10587 303 aa35.69■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 CASZ1Q86V15 1759 aa35.69■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 MAP3K5Q99683 1374 aa35.67■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 PHF14O94880 888 aa35.65■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 LINC00116Q8NCU8 138 aa35.65■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 GNPATO15228 680 aa35.64■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 PTGER2P43116 358 aa35.64■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 ITPK1Q13572 414 aa35.64■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 C5P01031 1676 aa35.64■■■■□ 3.3
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC5Q8N0Z6 440 aa35.63■■■■□ 3.29
CCZ1B-211ENST00000486840 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.63■■■■□ 3.29
CCZ1B-211ENST00000486840 ARXQ96QS3 562 aa35.63■■■■□ 3.29
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CCZ1B-211ENST00000486840 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.57■■■■□ 3.29
CCZ1B-211ENST00000486840 C4BP0C0L5 1744 aa35.57■■■■□ 3.29
CCZ1B-211ENST00000486840 SCN11AQ9UI33 1791 aa35.57■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 KLHL34Q8N239 644 aa35.57■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC39A6Q13433 755 aa35.56■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 TRAPPC3LQ5T215 181 aa35.56■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 QSER1Q2KHR3 1735 aa35.56■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 IL17REQ8NFR9 667 aa35.54■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 TAF1LQ8IZX4 1826 aa35.53■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 MSL1Q68DK7 614 aa35.53■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC4A9Q96Q91 983 aa35.53■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 SGIP1Q9BQI5 828 aa35.52■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa35.52■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.28
CCZ1B-211ENST00000486840 ADRA2BP18089 450 aa35.49■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 RFC4P35249 363 aa35.49■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 MRC1P22897 1456 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 BTBD11A6QL63 1104 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 RPS6KA4O75676 772 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 CRKLP46109 303 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 VSIG10Q8N0Z9 540 aa35.47■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 SYT17Q9BSW7 474 aa35.47■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
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CCZ1B-211ENST00000486840 SMIM5Q71RC9 77 aa35.46■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF790Q6PG37 636 aa35.45■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 MCM10Q7L590 875 aa35.45■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 DNAJC10Q8IXB1 793 aa35.45■■■■□ 3.27
CCZ1B-211ENST00000486840 STARD3NLO95772 234 aa35.44■■■■□ 3.26
CCZ1B-211ENST00000486840 FMNL2Q96PY5 1086 aa35.43■■■■□ 3.26
CCZ1B-211ENST00000486840 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF831Q5JPB2 1677 aa35.43■■■■□ 3.26
CCZ1B-211ENST00000486840 NFE2L2Q16236 605 aa35.42■■■■□ 3.26
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC87Q9NVE4 849 aa35.42■■■■□ 3.26
CCZ1B-211ENST00000486840 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa35.41■■■■□ 3.26
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CCZ1B-211ENST00000486840 AMIGO3Q86WK7 504 aa35.41■■■■□ 3.26
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
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CCZ1B-211ENST00000486840 UBR3Q6ZT12 1888 aa35.37■■■■□ 3.25
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CCZ1B-211ENST00000486840 HEG1Q9ULI3 1381 aa35.33■■■■□ 3.25
CCZ1B-211ENST00000486840 ANP32CO43423 234 aa35.32■■■■□ 3.24
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CCZ1B-211ENST00000486840 KCPQ6ZWJ8 1503 aa35.3■■■■□ 3.24
CCZ1B-211ENST00000486840 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
CCZ1B-211ENST00000486840 MMP10P09238 476 aa35.29■■■■□ 3.24
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR162Q16538 588 aa35.29■■■■□ 3.24
CCZ1B-211ENST00000486840 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CCZ1B-211ENST00000486840 CD2APQ9Y5K6 639 aa35.29■■■■□ 3.24
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.28■■■■□ 3.24
CCZ1B-211ENST00000486840 RUNDC1Q96C34 613 aa35.28■■■■□ 3.24
CCZ1B-211ENST00000486840 PARP3Q9Y6F1 533 aa35.28■■■■□ 3.24
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