RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483015.1

MIB2-211, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 3

Gene MIB2, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-211	ENST00000483015	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.83	■■■□□ 2.85
MIB2-211	ENST00000483015	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
MIB2-211	ENST00000483015	FCHSD2	O94868	740 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MIB2-211	ENST00000483015	NEFM	P07197	916 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MIB2-211	ENST00000483015	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
MIB2-211	ENST00000483015	CHD4	Q14839	1912 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MIB2-211	ENST00000483015	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
MIB2-211	ENST00000483015	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
MIB2-211	ENST00000483015	KCNQ4	P56696	695 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MIB2-211	ENST00000483015	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MIB2-211	ENST00000483015	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	SIK1	P57059	783 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	UTRN	P46939	3433 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	C5	P01031	1676 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	GPR162	Q16538	588 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	MRC1	P22897	1456 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MIB2-211	ENST00000483015	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	MSH5	O43196	834 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	AK7	Q96M32	723 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	KLHL34	Q8N239	644 aa		32.67	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	TEF	Q10587	303 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.64	■■■□□ 2.82
MIB2-211	ENST00000483015	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
MIB2-211	ENST00000483015	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MIB2-211	ENST00000483015	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.61	■■■□□ 2.81
MIB2-211	ENST00000483015	GRIN3B	O60391	1043 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MIB2-211	ENST00000483015	SSFA2	P28290	1259 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-211	ENST00000483015	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-211	ENST00000483015	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-211	ENST00000483015	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
MIB2-211	ENST00000483015	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	ITPK1	Q13572	414 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	GNPAT	O15228	680 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-211	ENST00000483015	ADRA2B	P18089	450 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	PHF14	O94880	888 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	ANP32C	O43423	234 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MIB2-211	ENST00000483015	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	32.44	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	MCM10	Q7L590	875 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	TJP1	Q07157	1748 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	STARD3NL	O95772	234 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MIB2-211	ENST00000483015	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
MIB2-211	ENST00000483015	RFC4	P35249	363 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MIB2-211	ENST00000483015	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77

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