RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 OXER1Q8TDS5 423 aa6.08□□□□□ -1.44
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SHQ1-208ENST00000482785 BTG4Q9NY30 223 aa6.08□□□□□ -1.44
SHQ1-208ENST00000482785 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.08□□□□□ -1.44
SHQ1-208ENST00000482785 ADGRL2O95490 1459 aa6.08□□□□□ -1.44
SHQ1-208ENST00000482785 CEP290O15078 2479 aa6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-208ENST00000482785 PDE3BQ13370 1112 aa6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-208ENST00000482785 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-208ENST00000482785 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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SHQ1-208ENST00000482785 PHOX2BQ99453 314 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 EPAS1Q99814 870 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 QSER1Q2KHR3 1735 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 LTBP1Q14766 1721 aa5.97□□□□□ -1.45
SHQ1-208ENST00000482785 MTUS2Q5JR59 1369 aa5.97□□□□□ -1.45
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