RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478725.5

GUK1-223, Transcript of guanylate kinase 1, human

TSL 3

Gene GUK1, Length 414 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GUK1-223	ENST00000478725	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GUK1-223	ENST00000478725	AK7	Q96M32	723 aa		18.48	■□□□□ 0.55
GUK1-223	ENST00000478725	MSH5	O43196	834 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GUK1-223	ENST00000478725	ATP6V1A	P38606	617 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GUK1-223	ENST00000478725	ITPK1	Q13572	414 aa		18.47	■□□□□ 0.55
GUK1-223	ENST00000478725	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GUK1-223	ENST00000478725	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GUK1-223	ENST00000478725	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GUK1-223	ENST00000478725	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		18.44	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	SSFA2	P28290	1259 aa		18.43	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	GNPAT	O15228	680 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	PHF14	O94880	888 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	PPP2R1A	P30153	589 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	MSL1	Q68DK7	614 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	CFAP53	Q96M91	514 aa		18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	SMIM5	Q71RC9	77 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	MRC1	P22897	1456 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	LGR6	Q9HBX8	967 aa		18.4	■□□□□ 0.54
GUK1-223	ENST00000478725	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	KLHL34	Q8N239	644 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	UTRN	P46939	3433 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	NUDC	Q9Y266	331 aa		18.36	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	ADRA2B	P18089	450 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		18.35	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	YY1	P25490	414 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	PRKAR2B	P31323	418 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		18.34	■□□□□ 0.53
GUK1-223	ENST00000478725	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	RPS6KA4	O75676	772 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		18.33	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	TJP1	Q07157	1748 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	18.32	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	SLC39A6	Q13433	755 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		18.32	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	FCHSD2	O94868	740 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	GPR162	Q16538	588 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	RFC4	P35249	363 aa		18.29	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		18.29	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		18.29	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	MMP10	P09238	476 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	TEF	Q10587	303 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		18.28	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	GYS1	P13807	737 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GUK1-223	ENST00000478725	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		18.26	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	ZNF790	Q6PG37	636 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	C4A	P0C0L4	1744 aa		18.25	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	18.24	■□□□□ 0.51	7e-15	■□□□□ 9.5
GUK1-223	ENST00000478725	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	RALBP1	Q15311	655 aa		18.23	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	GRIN3B	O60391	1043 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		18.22	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		18.21	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	STARD3NL	O95772	234 aa		18.21	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		18.21	■□□□□ 0.51
GUK1-223	ENST00000478725	BTBD11	A6QL63	1104 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GUK1-223	ENST00000478725	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
GUK1-223	ENST00000478725	FKBP8	Q14318	412 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GUK1-223	ENST00000478725	MCM10	Q7L590	875 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GUK1-223	ENST00000478725	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GUK1-223	ENST00000478725	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GUK1-223	ENST00000478725	COL15A1	P39059	1388 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GUK1-223	ENST00000478725	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5

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