RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 IP6K1Q92551 441 aa8.54□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 TNS2Q63HR2 1409 aa8.54□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 FYB1O15117 783 aa8.54□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 PLCG2P16885 1265 aa8.54□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.54□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.54□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.53□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 IL2RBP14784 551 aa8.53□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 HOXC9P31274 260 aa8.53□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 GOLGA2Q08379 1002 aa8.53□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.53□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.53□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.52□□□□□ -1.04
MITF-215ENST00000478490 CASZ1Q86V15 1759 aa8.52□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 NBPF14Q5TI25 921 aa8.52□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.52□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 ITGB4P16144 1822 aa8.52□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 CDCA8Q53HL2 280 aa8.51□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 OCEL1Q9H607 264 aa8.51□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 MEGF6O75095 1541 aa8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 PLSCR1O15162 318 aa8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 NBPF4Q96M43 638 aa8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.5□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 LY75O60449 1722 aa8.49□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 TXNRD1Q16881 649 aa8.49□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 BCL9O00512 1426 aa8.49□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.48□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 KCNQ4P56696 695 aa8.48□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.48□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.48□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 RTL1A6NKG5 1358 aa8.48□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 ZBTB7AO95365 584 aa8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 PAPPAQ13219 1627 aa8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 STK32BQ9NY57 414 aa8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.47□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 INSRP06213 1382 aa8.46□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 FLT4P35916 1363 aa8.46□□□□□ -1.05
MITF-215ENST00000478490 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.46□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 PANK3Q9H999 370 aa8.46□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.46□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.46□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 RGL2O15211 777 aa8.45□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 SLC15A2Q16348 729 aa8.45□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.45□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 SPON1Q9HCB6 807 aa8.45□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.45□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 C5P01031 1676 aa8.45□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 ZNF827Q17R98 1081 aa8.44□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.44□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.44□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 NSD2O96028 1365 aa8.44□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 POLKQ9UBT6 870 aa8.43□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 EYA1Q99502 592 aa8.43□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 UTRNP46939 3433 aa8.43□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 CYP27B1O15528 508 aa8.41□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.41□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.41□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.41□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.41□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 PTGER2P43116 358 aa8.4□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.4□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.4□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 MORC1Q86VD1 984 aa8.4□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
MITF-215ENST00000478490 CHD4Q14839 1912 aa8.4□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.4□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.4□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.4□□□□□ -1.07
MITF-215ENST00000478490 NCAPD2Q15021 1401 aa8.39□□□□□ -1.07
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