RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	LGR6	Q9HBX8	967 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATG3	Q9NT62	314 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP3K5	Q99683	1374 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB7A	O95365	584 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	14.92	□□□□□ -0.02	6e-7	■□□□□ 10.6
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITPK1	Q13572	414 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		14.91	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		14.9	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIK1	P57059	783 aa		14.9	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	CABP4	P57796	275 aa		14.9	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	RALBP1	Q15311	655 aa		14.9	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM5	Q71RC9	77 aa		14.9	□□□□□ -0.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		14.89	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUDC	Q9Y266	331 aa		14.89	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		14.88	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTGER2	P43116	358 aa		14.88	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		14.88	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		14.87	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		14.87	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		14.87	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		14.87	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP6V1A	P38606	617 aa		14.86	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC39A6	Q13433	755 aa		14.86	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		14.86	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPON1	Q9HCB6	807 aa		14.86	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		14.85	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	FCHSD2	O94868	740 aa		14.85	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		14.85	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		14.85	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	AK7	Q96M32	723 aa		14.84	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTFR1L	Q9H019	292 aa		14.84	□□□□□ -0.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHF14	O94880	888 aa		14.83	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCTN1	Q14203	1278 aa		14.83	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCM10	Q7L590	875 aa		14.83	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNPAT	O15228	680 aa		14.82	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSL1	Q68DK7	614 aa		14.82	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		14.81	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCN7A	Q01118	1682 aa		14.81	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC184	Q52MB2	194 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSH5	O43196	834 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNQ3	O43525	872 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEF	Q10587	303 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	SSFA2	P28290	1259 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		14.77	□□□□□ -0.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFE2L2	Q16236	605 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF790	Q6PG37	636 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		14.75	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARX	Q96QS3	562 aa		14.75	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		14.75	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		14.74	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		14.74	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		14.74	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL15A1	P39059	1388 aa		14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTBD11	A6QL63	1104 aa		14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS6KA4	O75676	772 aa		14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		14.72	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLHL34	Q8N239	644 aa		14.72	□□□□□ -0.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		14.72	□□□□□ -0.05

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