RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USP47	Q96K76	1375 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MS4A1	P11836	297 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BTAF1	O14981	1849 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RTL1	A6NKG5	1358 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDCA8	Q53HL2	280 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.83	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LTN1	O94822	1766 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.82	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UTRN	P46939	3433 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HOXC9	P31274	260 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.81	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBR1	Q14596	966 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A1W2PP64	1363 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMF1	P82094	1093 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NSD2	O96028	1365 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AK7	Q96M32	723 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LY75	O60449	1722 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	INSR	P06213	1382 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SSFA2	P28290	1259 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FLT4	P35916	1363 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PALLD	Q8WX93	1383 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FYB1	O15117	783 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NEFM	P07197	916 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSPA6	P17066	643 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TESK2	Q96S53	571 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KCNQ4	P56696	695 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MEGF6	O75095	1541 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TGFB2	P61812	414 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RALBP1	Q15311	655 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	APLP1	P51693	650 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SIK1	P57059	783 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C5	P01031	1676 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGL2	O15211	777 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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