RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 RGS12O14924 1447 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 MRC1P22897 1456 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SCN11AQ9UI33 1791 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 PIGBQ92521 554 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 MBIPQ9NS73 344 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM182BQ5T319 152 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF790Q6PG37 636 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 KAT6BQ8WYB5 2073 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNQ2O43526 872 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A6Q13433 755 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
SH3BP4-208ENST00000462602 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 FMNL2Q96PY5 1086 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNQ3O43525 872 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ATG3Q9NT62 314 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 DOT1LQ8TEK3 1739 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM37O94972 964 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXB7P09629 217 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF428Q96B54 188 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 VSIG10Q8N0Z9 540 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGB4P16144 1822 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 NHSQ6T4R5 1651 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 PALLDQ8WX93 1383 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 VAMP4O75379 141 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPYL6Q8N831 410 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT24Q2M2I5 525 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SIK1P57059 783 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 RCAN3Q9UKA8 241 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 PAPPAQ13219 1627 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SBF2Q86WG5 1849 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 STARD3NLO95772 234 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 APBA3O96018 575 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V1AP38606 617 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 PLSCR1O15162 318 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC125Q86Z20 511 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 STK31Q9BXU1 1019 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 BTAF1O14981 1849 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC10Q8IXB1 793 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 USP16Q9Y5T5 823 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 ERBB4Q15303 1308 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 UBR2Q8IWV8 1755 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC4A9Q96Q91 983 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 BAG6P46379 1132 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 NECTIN2Q92692 538 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC4A2P04920 1241 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP4-208ENST00000462602 ITPK1Q13572 414 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP4-208ENST00000462602 TXNRD1Q16881 649 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms