RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SH3BP5-208	ENST00000459627	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	AK7	Q96M32	723 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	PHF14	O94880	888 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC39A6	Q13433	755 aa		32	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARX	Q96QS3	562 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	GNPAT	O15228	680 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAP3K5	Q99683	1374 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	MRC1	P22897	1456 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	KLHL34	Q8N239	644 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SH3BP5-208	ENST00000459627	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	POLD1	P28340	1107 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	SYT17	Q9BSW7	474 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	TJP1	Q07157	1748 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	FCHSD2	O94868	740 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	RALBP1	Q15311	655 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	SSFA2	P28290	1259 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	TEF	Q10587	303 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	DCTN1	Q14203	1278 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	MCM10	Q7L590	875 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SH3BP5-208	ENST00000459627	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	KCNQ3	O43525	872 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF790	Q6PG37	636 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	BTBD11	A6QL63	1104 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	RFC4	P35249	363 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	C4A	P0C0L4	1744 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	NEFM	P07197	916 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	MMP10	P09238	476 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	GYS1	P13807	737 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	ADRA2B	P18089	450 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	YY1	P25490	414 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
SH3BP5-208	ENST00000459627	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	NFE2L2	Q16236	605 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SH3BP5-208	ENST00000459627	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66

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