RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa37.24■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 LINC00116Q8NCU8 138 aa37.24■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 SGIP1Q9BQI5 828 aa37.24■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 PHF14O94880 888 aa37.22■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 ITPK1Q13572 414 aa37.22■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 ARXQ96QS3 562 aa37.22■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 POLD1P28340 1107 aa37.21■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 SCN11AQ9UI33 1791 aa37.2■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 LGR6Q9HBX8 967 aa37.2■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 NUDCQ9Y266 331 aa37.2■■■■□ 3.55
FAAP20-210ENST00000440825 SMIM5Q71RC9 77 aa37.19■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 MSL1Q68DK7 614 aa37.18■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 KLHL34Q8N239 644 aa37.18■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 FLAD1Q8NFF5 587 aa37.17■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 RNMTO43148 476 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 GNPATO15228 680 aa37.15■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP37.15■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 AMIGO3Q86WK7 504 aa37.15■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 SLC4A9Q96Q91 983 aa37.14■■■■□ 3.54
FAAP20-210ENST00000440825 SLC52A2Q9HAB3 445 aa37.13■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 DCAF8L1A6NGE4 600 aa37.12■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 PRKAR2BP31323 418 aa37.12■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 SYT17Q9BSW7 474 aa37.12■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 UBR3Q6ZT12 1888 aa37.11■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 GAS2L2Q8NHY3 880 aa37.1■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 RSPH6AQ9H0K4 717 aa37.09■■■■□ 3.53
FAAP20-210ENST00000440825 SSFA2P28290 1259 aa37.07■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 MAP3K5Q99683 1374 aa37.06■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 PHACTR3Q96KR7 559 aa37.06■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 GNAT3A8MTJ3 354 aa37.05■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 SLC39A6Q13433 755 aa37.05■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 COL24A1Q17RW2 1714 aa37.05■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 MRC1P22897 1456 aa37.04■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF831Q5JPB2 1677 aa37.03■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
FAAP20-210ENST00000440825 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa37■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 TEFQ10587 303 aa36.99■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 FCHSD2O94868 740 aa36.98■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 TRAPPC3LQ5T215 181 aa36.98■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 IL17REQ8NFR9 667 aa36.98■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa36.98■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 CRKLP46109 303 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 TJP1Q07157 1748 aa36.96■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 RALBP1Q15311 655 aa36.95■■■■□ 3.51
FAAP20-210ENST00000440825 DNAJC10Q8IXB1 793 aa36.94■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 TTC5Q8N0Z6 440 aa36.94■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 RPS6KA4O75676 772 aa36.92■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 NEFMP07197 916 aa36.9■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 RFC4P35249 363 aa36.9■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 NLGN2Q8NFZ4 835 aa36.9■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 KCPQ6ZWJ8 1503 aa36.9■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
FAAP20-210ENST00000440825 ADRA2BP18089 450 aa36.88■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 MCM10Q7L590 875 aa36.86■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC87Q9NVE4 849 aa36.85■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 GPR162Q16538 588 aa36.84■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa36.83■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 DCTN1Q14203 1278 aa36.83■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF790Q6PG37 636 aa36.83■■■■□ 3.49
FAAP20-210ENST00000440825 UBR2Q8IWV8 1755 aa36.82■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 BTBD11A6QL63 1104 aa36.82■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 MMP10P09238 476 aa36.81■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 C4AP0C0L4 1744 aa36.81■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 YY1P25490 414 aa36.8■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 VSIG10Q8N0Z9 540 aa36.8■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 NLGN1Q8N2Q7 840 aa36.79■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 GYS1P13807 737 aa36.78■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 CD2APQ9Y5K6 639 aa36.78■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.78■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 KCNQ3O43525 872 aa36.76■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa36.76■■■■□ 3.48
FAAP20-210ENST00000440825 STARD3NLO95772 234 aa36.75■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 FMNL2Q96PY5 1086 aa36.75■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHF1Q96S99 279 aa36.75■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 HEG1Q9ULI3 1381 aa36.75■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 CANXP27824 592 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
FAAP20-210ENST00000440825 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms