RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 WWC1Q8IX03 1113 aa20.91■□□□□ 0.94
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CNGA3-205ENST00000436404 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.91■□□□□ 0.94
CNGA3-205ENST00000436404 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CNGA3-205ENST00000436404 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CNGA3-205ENST00000436404 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
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CNGA3-205ENST00000436404 SMC5Q8IY18 1101 aa20.86■□□□□ 0.93
CNGA3-205ENST00000436404 SNX21Q969T3 373 aa20.86■□□□□ 0.93
CNGA3-205ENST00000436404 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.85■□□□□ 0.93
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CNGA3-205ENST00000436404 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
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CNGA3-205ENST00000436404 ADAMTS2O95450 1211 aa20.82■□□□□ 0.92
CNGA3-205ENST00000436404 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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CNGA3-205ENST00000436404 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CNGA3-205ENST00000436404 LRP6O75581 1613 aa20.81■□□□□ 0.92
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CNGA3-205ENST00000436404 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CNGA3-205ENST00000436404 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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CNGA3-205ENST00000436404 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.79■□□□□ 0.92
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CNGA3-205ENST00000436404 SLIT2O94813 1529 aa20.78■□□□□ 0.92
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CNGA3-205ENST00000436404 LRRC37A3O60309 1634 aa20.77■□□□□ 0.92
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CNGA3-205ENST00000436404 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.77■□□□□ 0.92
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CNGA3-205ENST00000436404 TNNQ9UQP3 1299 aa20.76■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.75■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.75■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.75■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.74■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.74■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 IL16Q14005 1332 aa20.74■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 MCM10Q7L590 875 aa20.74■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.73■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 MAP3K5Q99683 1374 aa20.73■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.73■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.73■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.73■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.72■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.72■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
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CNGA3-205ENST00000436404 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.71■□□□□ 0.91
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CNGA3-205ENST00000436404 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF445P59923 1031 aa20.71■□□□□ 0.91
CNGA3-205ENST00000436404 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
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CNGA3-205ENST00000436404 ZNF853P0CG23 659 aa20.7■□□□□ 0.9
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CNGA3-205ENST00000436404 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.7■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
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CNGA3-205ENST00000436404 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.7■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 IL17REQ8NFR9 667 aa20.69■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 DISP2A7MBM2 1401 aa20.69■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 MCM5P33992 734 aa20.68■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.68■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 C8orf37Q96NL8 207 aa20.68■□□□□ 0.9
CNGA3-205ENST00000436404 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.68■□□□□ 0.9
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