RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436200.2

CCDC18-AS1-210, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 492 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L15C9J2P7 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L10C9JJH3 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L12C9JPN9 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L11C9JVI0 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L21D6R901 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L18D6R9N7 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L22D6RA61 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L19D6RCP7 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L20D6RJB6 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GPC1P35052 558 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP17L24Q0WX57 530 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PTK7Q13308 1070 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SIX5Q8N196 739 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.22□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DKK1O94907 266 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TLR1Q15399 786 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZNF358Q9NW07 568 aa7.21□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SFI1A8K8P3 1242 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 BACH1O14867 736 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SMTNP53814 917 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DPYDQ12882 1025 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SEC13P55735 322 aa7.19□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 A6NJY4 79 aa7.18□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ATG7O95352 703 aa7.18□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ARXQ96QS3 562 aa7.18□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RHOQP17081 205 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 POU4F2Q12837 409 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MTFR1Q15390 333 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TNS4Q8IZW8 715 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.17□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 M0R2N6 131 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CDK2AP1O14519 115 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 EPHA4P54764 986 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PTSQ03393 145 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GNASQ5JWF2 1037 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NBPF15Q8N660 670 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.16□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 STK32AQ8WU08 396 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 HINFPQ9BQA5 517 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 USP3Q9Y6I4 520 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PHKA2P46019 1235 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FOXK2Q01167 660 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 C4orf17Q53FE4 359 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TBCELQ5QJ74 424 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.14□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LGR5O75473 907 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 WDR44Q5JSH3 913 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.13□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SLC35F4A4IF30 521 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PLA2G4AP47712 749 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CABP1Q9NZU7 370 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 C21orf2O43822 256 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PPFIA3O75145 1194 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 VEGFBP49765 207 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.1□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 A0A1B0GTH6 734 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NOS2P35228 1153 aa7.09□□□□□ -1.27
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms