RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434561.1

TP53BP1-208, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 3

Gene TP53BP1, Length 613 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-208	ENST00000434561	SIK1	P57059	783 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		12.66	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	PHKG2	P15735	406 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATP6V1A	P38606	617 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	RALBP1	Q15311	655 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATP10D	Q9P241	1426 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	GNPAT	O15228	680 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	GRIN3B	O60391	1043 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	TJP1	Q07157	1748 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		12.6	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	MMP10	P09238	476 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	SSFA2	P28290	1259 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.59	□□□□□ -0.39	2e-6	■■■■□ 25.1
TP53BP1-208	ENST00000434561	SBF1	O95248	1867 aa		12.59	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
TP53BP1-208	ENST00000434561	KDR	P35968	1356 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		12.58	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	ANP32C	O43423	234 aa		12.57	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561		A0A0G2JLW4	131 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	CABP4	P57796	275 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	CACNA1S	Q13698	1873 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	ADCY9	O60503	1353 aa		12.56	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	12.55	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	BCS1L	Q9Y276	419 aa		12.55	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	MTHFS	P49914	203 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	DCAF5	Q96JK2	942 aa		12.54	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	GYS1	P13807	737 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	DPEP1	P16444	411 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	RFC4	P35249	363 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TP53BP1-208	ENST00000434561	RPS6KA4	O75676	772 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	HMOX1	P09601	288 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	MIER1	Q8N108	512 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	IL13	P35225	146 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	LGR6	Q9HBX8	967 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	FCHSD2	O94868	740 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC39A6	Q13433	755 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	FKBP8	Q14318	412 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	KIF3C	O14782	793 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	CHRNA5	P30532	468 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	DDR1	Q08345	913 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	KCNA3	P22001	575 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TP53BP1-208	ENST00000434561	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41

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