RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423413.1

TNS1-206, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-206ENST00000423413 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.82□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.82□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 ATP6V1AP38606 617 aa14.81□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.81□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 ATG3Q9NT62 314 aa14.81□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 FCHSD2O94868 740 aa14.8□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.8□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 AK7Q96M32 723 aa14.8□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.8□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 MRC1P22897 1456 aa14.8□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 NEFMP07197 916 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 PRKAR2BP31323 418 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 MAP3K5Q99683 1374 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.79□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 MSH5O43196 834 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.78□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.77□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 LGR6Q9HBX8 967 aa14.77□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.77□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 TJP1Q07157 1748 aa14.77□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 POLD1P28340 1107 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 PTGER2P43116 358 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.76□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 TEFQ10587 303 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 ITPK1Q13572 414 aa14.75□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 SSFA2P28290 1259 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.74□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 GNPATO15228 680 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 ARXQ96QS3 562 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.73□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.72□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.72□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 PHF14O94880 888 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 IL17REQ8NFR9 667 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 C4AP0C0L4 1744 aa14.71□□□□□ -0.05
TNS1-206ENST00000423413 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.71□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.71□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.7□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 ADRA2BP18089 450 aa14.7□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.7□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 RPS6KA4O75676 772 aa14.69□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 SLC39A6Q13433 755 aa14.69□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.69□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 BTBD11A6QL63 1104 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 MSL1Q68DK7 614 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 ZNF790Q6PG37 636 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 SYT17Q9BSW7 474 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 RFC4P35249 363 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 NFE2L2Q16236 605 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 MCM10Q7L590 875 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 KLHL34Q8N239 644 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-206ENST00000423413 STARD3NLO95772 234 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 SMIM5Q71RC9 77 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 DCTN1Q14203 1278 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 CHD4Q14839 1912 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS1-206ENST00000423413 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms