RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421101.1

LRRN3-202, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

TSL 2

Gene LRRN3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-202ENST00000421101 VAMP4O75379 141 aa9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 NEFLP07196 543 aa9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 USP21Q9UK80 565 aa9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.53□□□□□ -0.88
LRRN3-202ENST00000421101 EXOC5O00471 708 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 RRP1P56182 461 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 FKBP8Q14318 412 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 VPS72Q15906 364 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 POTEGQ6S5H5 508 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 TSPYL6Q8N831 410 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 LRP6O75581 1613 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 BTBD11A6QL63 1104 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 PLIN1O60240 522 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.52□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.51□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 KRT24Q2M2I5 525 aa9.51□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 BARGINQ6ZT62 677 aa9.51□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 ZNF428Q96B54 188 aa9.51□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.51□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 DISP2A7MBM2 1401 aa9.5□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 SLC4A2P04920 1241 aa9.5□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.5□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.5□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.5□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 KCNQ3O43525 872 aa9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 CABP4P57796 275 aa9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 DDB1Q16531 1140 aa9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 NRAPQ86VF7 1730 aa9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 AFF2P51816 1311 aa9.49□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 POTEIP0CG38 1075 aa9.48□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 FBXO41Q8TF61 875 aa9.48□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.48□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 ZNF790Q6PG37 636 aa9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 LRRC37A3O60309 1634 aa9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 SLC39A6Q13433 755 aa9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.46□□□□□ -0.89
LRRN3-202ENST00000421101 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.46□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 PDE3AQ14432 1141 aa9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 EP400Q96L91 3159 aa9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 TNS2Q63HR2 1409 aa9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 KIF16BQ96L93 1317 aa9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 A0A0G2JS52 829 aa9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 HOXB7P09629 217 aa9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 MYT1Q01538 1121 aa9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 PIGBQ92521 554 aa9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.44□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 NECTIN2Q92692 538 aa9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 MRC1P22897 1456 aa9.43□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.42□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 TRIM27P14373 513 aa9.42□□□□□ -0.9
LRRN3-202ENST00000421101 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms