RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTBD11A6QL63 1104 aa21.95■■□□□ 1.1
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RXRBP28702 533 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.94■■□□□ 1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.93■■□□□ 1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.91■■□□□ 1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCL9O00512 1426 aa21.89■■□□□ 1.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF428Q96B54 188 aa21.88■■□□□ 1.09
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.88■■□□□ 1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 POTEAQ6S8J7 498 aa21.87■■□□□ 1.09
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.87■■□□□ 1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.87■■□□□ 1.09
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.86■■□□□ 1.09
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 VAMP4O75379 141 aa21.84■■□□□ 1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXB7P09629 217 aa21.84■■□□□ 1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPYL6Q8N831 410 aa21.84■■□□□ 1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.84■■□□□ 1.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNQ3O43525 872 aa21.83■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC39A6Q13433 755 aa21.83■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.82■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.82■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.82■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.82■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT24Q2M2I5 525 aa21.81■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.81■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGS12O14924 1447 aa21.8■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.8■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.79■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATG3Q9NT62 314 aa21.79■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM182BQ5T319 152 aa21.78■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.78■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNQ2O43526 872 aa21.76■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.76■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.75■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.75■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.75■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAPPAQ13219 1627 aa21.75■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.74■■□□□ 1.07
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.74■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.74■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCAR3O75815 825 aa21.74■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.74■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 STK31Q9BXU1 1019 aa21.73■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF16BQ96L93 1317 aa21.71■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.71■■□□□ 1.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PALLDQ8WX93 1383 aa21.7■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 NHSQ6T4R5 1651 aa21.7■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.69■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGB4P16144 1822 aa21.68■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.68■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC4A2P04920 1241 aa21.67■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.67■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP16Q9Y5T5 823 aa21.67■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERBB4Q15303 1308 aa21.66■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.66■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIK1P57059 783 aa21.66■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 NECTIN2Q92692 538 aa21.66■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.66■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM37O94972 964 aa21.65■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 STARD3NLO95772 234 aa21.65■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.65■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.64■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.64■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.64■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRCP08575 1304 aa21.64■■□□□ 1.05
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