RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATG3Q9NT62 314 aa18.08■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CABP4P57796 275 aa18.07■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP6V1AP38606 617 aa18.06■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C5P01031 1676 aa18.06■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HMOX1P09601 288 aa18.05■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAP3K5Q99683 1374 aa18.04■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.04■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.04■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITPK1Q13572 414 aa18.03■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.03■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C4BP0C0L5 1744 aa18.03■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MSL1Q68DK7 614 aa18.02■□□□□ 0.48
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLHL34Q8N239 644 aa18.02■□□□□ 0.48
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 SSFA2P28290 1259 aa18.01■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.01■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GNPATO15228 680 aa18■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 YY1P25490 414 aa18■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AMIGO3Q86WK7 504 aa18■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.99■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMIM5Q71RC9 77 aa17.99■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFAP53Q96M91 514 aa17.99■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC4A9Q96Q91 983 aa17.98■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LGR6Q9HBX8 967 aa17.97■□□□□ 0.47
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC52A2Q9HAB3 445 aa17.96■□□□□ 0.47
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.95■□□□□ 0.46
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRAPPC3LQ5T215 181 aa17.94■□□□□ 0.46
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NLGN2Q8NFZ4 835 aa17.94■□□□□ 0.46
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NUDCQ9Y266 331 aa17.94■□□□□ 0.46
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBR3Q6ZT12 1888 aa17.93■□□□□ 0.46
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF831Q5JPB2 1677 aa17.93■□□□□ 0.46
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RPS6KA4O75676 772 aa17.92■□□□□ 0.46
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.92■□□□□ 0.46
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MRC1P22897 1456 aa17.9■□□□□ 0.46
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 FCHSD2O94868 740 aa17.86■□□□□ 0.45
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 IL17REQ8NFR9 667 aa17.86■□□□□ 0.45
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.86■□□□□ 0.45
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 VSIG10Q8N0Z9 540 aa17.85■□□□□ 0.45
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC87Q9NVE4 849 aa17.85■□□□□ 0.45
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.85■□□□□ 0.45
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.82■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TJP1Q07157 1748 aa17.82■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF790Q6PG37 636 aa17.81■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PARP3Q9Y6F1 533 aa17.81■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa17.8■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 STARD3NLO95772 234 aa17.8■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZPR1O75312 459 aa17.79■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NEFMP07197 916 aa17.79■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BTBD11A6QL63 1104 aa17.78■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TGFB2P61812 414 aa17.78■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FKBP8Q14318 412 aa17.78■□□□□ 0.44
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FMNL2Q96PY5 1086 aa17.78■□□□□ 0.44
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