RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 MSH5O43196 834 aa41.2■■■■■ 4.19
CMTM4-202ENST00000394106 ATP6V1AP38606 617 aa41.2■■■■■ 4.19
CMTM4-202ENST00000394106 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 LGR6Q9HBX8 967 aa41.19■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 SLC16A10Q8TF71 515 aa41.18■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 AK7Q96M32 723 aa41.18■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP41.17■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 ITPK1Q13572 414 aa41.17■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 LINC00116Q8NCU8 138 aa41.17■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 RNMTO43148 476 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 PRKAR2BP31323 418 aa41.15■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 SGIP1Q9BQI5 828 aa41.14■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 RSPH6AQ9H0K4 717 aa41.14■■■■■ 4.18
CMTM4-202ENST00000394106 GAS2L2Q8NHY3 880 aa41.12■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 SLC52A2Q9HAB3 445 aa41.12■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 SLC4A9Q96Q91 983 aa41.1■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 FLAD1Q8NFF5 587 aa41.09■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 PHACTR3Q96KR7 559 aa41.09■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 UBR3Q6ZT12 1888 aa41.09■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 MRC1P22897 1456 aa41.09■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa41.08■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 PHF14O94880 888 aa41.08■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 MAP3K5Q99683 1374 aa41.08■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF831Q5JPB2 1677 aa41.07■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 SMIM5Q71RC9 77 aa41.07■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 AMIGO3Q86WK7 504 aa41.07■■■■■ 4.17
CMTM4-202ENST00000394106 RALBP1Q15311 655 aa41.06■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 ARXQ96QS3 562 aa41.06■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 GNAT3A8MTJ3 354 aa41.05■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 POLD1P28340 1107 aa41.05■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 GNPATO15228 680 aa41.04■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 FCHSD2O94868 740 aa41.03■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 COL24A1Q17RW2 1714 aa41.03■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 MSL1Q68DK7 614 aa41.02■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
CMTM4-202ENST00000394106 SSFA2P28290 1259 aa40.99■■■■■ 4.15
CMTM4-202ENST00000394106 SLC39A6Q13433 755 aa40.99■■■■■ 4.15
CMTM4-202ENST00000394106 IL17REQ8NFR9 667 aa40.98■■■■■ 4.15
CMTM4-202ENST00000394106 TEFQ10587 303 aa40.95■■■■■ 4.15
CMTM4-202ENST00000394106 TJP1Q07157 1748 aa40.95■■■■■ 4.15
CMTM4-202ENST00000394106 SYT17Q9BSW7 474 aa40.94■■■■■ 4.14
CMTM4-202ENST00000394106 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa40.93■■■■■ 4.14
CMTM4-202ENST00000394106 KLHL34Q8N239 644 aa40.93■■■■■ 4.14
CMTM4-202ENST00000394106 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CMTM4-202ENST00000394106 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CMTM4-202ENST00000394106 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
CMTM4-202ENST00000394106 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
CMTM4-202ENST00000394106 KCPQ6ZWJ8 1503 aa40.89■■■■■ 4.14
CMTM4-202ENST00000394106 NEFMP07197 916 aa40.88■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 CRKLP46109 303 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 TRAPPC3LQ5T215 181 aa40.87■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 TTC5Q8N0Z6 440 aa40.87■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa40.86■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 DNAJC10Q8IXB1 793 aa40.86■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 DCAF8L1A6NGE4 600 aa40.85■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 RPS6KA4O75676 772 aa40.85■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 UBR2Q8IWV8 1755 aa40.84■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 MCM10Q7L590 875 aa40.83■■■■■ 4.13
CMTM4-202ENST00000394106 ADRA2BP18089 450 aa40.81■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 PLEKHF1Q96S99 279 aa40.8■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF790Q6PG37 636 aa40.79■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 DCTN1Q14203 1278 aa40.78■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 BTBD11A6QL63 1104 aa40.77■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 RFC4P35249 363 aa40.77■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 VSIG10Q8N0Z9 540 aa40.77■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC87Q9NVE4 849 aa40.77■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa40.76■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
CMTM4-202ENST00000394106 C4AP0C0L4 1744 aa40.76■■■■■ 4.11
CMTM4-202ENST00000394106 DLG5Q8TDM6 1919 aa40.75■■■■■ 4.11
CMTM4-202ENST00000394106 KCNQ3O43525 872 aa40.71■■■■■ 4.11
CMTM4-202ENST00000394106 NFE2L2Q16236 605 aa40.71■■■■■ 4.11
CMTM4-202ENST00000394106 NLGN2Q8NFZ4 835 aa40.71■■■■■ 4.11
CMTM4-202ENST00000394106 HEG1Q9ULI3 1381 aa40.71■■■■■ 4.11
CMTM4-202ENST00000394106 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CMTM4-202ENST00000394106 FMNL2Q96PY5 1086 aa40.7■■■■■ 4.11
CMTM4-202ENST00000394106 MMP10P09238 476 aa40.67■■■■■ 4.1
CMTM4-202ENST00000394106 GYS1P13807 737 aa40.67■■■■■ 4.1
CMTM4-202ENST00000394106 NLGN1Q8N2Q7 840 aa40.67■■■■■ 4.1
CMTM4-202ENST00000394106 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa40.67■■■■■ 4.1
CMTM4-202ENST00000394106 STARD3NLO95772 234 aa40.66■■■■■ 4.1
CMTM4-202ENST00000394106 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
CMTM4-202ENST00000394106 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CMTM4-202ENST00000394106 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP40.65■■■■■ 4.1
CMTM4-202ENST00000394106 CANXP27824 592 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms