RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP4-202ENST00000392011 ATP10BO94823 1461 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-202ENST00000392011 SSFA2P28290 1259 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-202ENST00000392011 PIP4K2BP78356 416 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-202ENST00000392011 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-202ENST00000392011 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP4-202ENST00000392011 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP4-202ENST00000392011 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4-202ENST00000392011 IL16Q14005 1332 aa20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.27■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.27■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 TESK2Q96S53 571 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K11Q16584 847 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 SOGA3Q5TF21 947 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 MEIS3Q99687 375 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP4-202ENST00000392011 GUCY1B3Q02153 619 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 GPTP24298 496 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.833e-6■■□□□ 14.2
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SH3BP4-202ENST00000392011 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 TNNQ9UQP3 1299 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 PLCH2O75038 1416 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 CHRNA2Q15822 529 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 CCP110O43303 1012 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS2O95450 1211 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP7D2Q96T17 732 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 DACH1Q9UI36 760 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ODF2Q5BJF6 829 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP4-202ENST00000392011 AK7Q96M32 723 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 NAPBQ9H115 298 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 STIM1Q13586 685 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC22Q5TAA0 569 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 SNRKQ9NRH2 765 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-202ENST00000392011 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-202ENST00000392011 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.2■□□□□ 0.82
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