RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380776.4

KCNQ1-204, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-204ENST00000380776 RLBP1P12271 317 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 LGR6Q9HBX8 967 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 MEGF6O75095 1541 aa8.68□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 STRN4Q9NRL3 753 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.67□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 MRC1P22897 1456 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 CABP4P57796 275 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 BTG4Q9NY30 223 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.66□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 JCADQ9P266 1359 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 CYP27B1O15528 508 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 PIP4K2BP78356 416 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 FLIIQ13045 1269 aa8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KCNQ1-204ENST00000380776 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 HEG1Q9ULI3 1381 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 KRT24Q2M2I5 525 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 ZNF790Q6PG37 636 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 HYPKQ9NX55 129 aa8.64□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 ERBB4Q15303 1308 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 EXOC5O00471 708 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 GNAI3P08754 354 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 CERKQ8TCT0 537 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 GCC1Q96CN9 775 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 TNNQ9UQP3 1299 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.63□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.62□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 HMMRO75330 724 aa8.62□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.62□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.62□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.62□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 DISP2A7MBM2 1401 aa8.62□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 RGS12O14924 1447 aa8.61□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 SLIT2O94813 1529 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 ALDH1L1O75891 902 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 ADAMTS2O95450 1211 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 IGHDP01880 384 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 BARGINQ6ZT62 677 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 SMC5Q8IY18 1101 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 DNAAF4Q8WXU2 420 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 LRP6O75581 1613 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 TNS2Q63HR2 1409 aa8.6□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 KCNQ3O43525 872 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 GNAI2P04899 355 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 G2E3Q7L622 706 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 USP35Q9P2H5 1018 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 ATP10DQ9P241 1426 aa8.59□□□□□ -1.03
KCNQ1-204ENST00000380776 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 NRAPQ86VF7 1730 aa8.58□□□□□ -1.04
KCNQ1-204ENST00000380776 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms